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Hay en Sepahua otro complejo Educativo, el "Leoncio Prado", que tienen una matrícula considerable: Secundaria, primaria e inicial.
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El inicial Rosa de Santa María, son matriculados 161 niños y niñas; tienen dirección propia y se les considera parte del complejo "P. Francisco Álvarez”.
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¿De dónde vienen los internos e internas? De muy lejos, unos comenzaron antes que otros; de Kirigueti, misión más cercana a Sepahua. En medio día por el río Urubamba, éste aquí ya sin graves peligros. Kirigueti tiene una población estudiantil numerosa. Todos Matshiguengas. Dejaron de pertenecer al internado de Sepahua hace muchos años.
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Koribeni; misión muy lejana de Sepahua, llegaron hasta 1988. Koribeni está muy lejos, en la provincia de La Convención, cerca de Quillabamba. Venían a dos días de viaje, primero por carretera mala - en camión - hasta kiteni, después por el río alto Urubamba, con sus peligros y por último por el mismo río, pero ya sin graves peligros de naufragio. Shintuya; Misión que está en el departamento de Madre de Dios y de las comunidades de nativos colindantes a los ríos afluentes derechos del gran río Madre de Dios, desde Shintuya al río Inambari. De allí debían surcar el gran río hasta llegar al aeropuerto de Boca Manu, embarcarse en la avioneta y en una hora y media llegaban a Sepahua. Felizmente estas tres misiones tienen todas sus colegios para educar a los niños y los de primera juventud. La misión de Timpía, recién ha comenzado allí el colegio de secundaria, están en el segundo año. Ellos tambien han dejado de matricularse en Sepahua. Muchos otros nativos que gozan ya de colegios en sus comunidades ya no vienen a matricularse en Sepahua. De las comunidades o pueblos que ya tienen colegios no admitimos a los jóvenes en nuestro internado. Sí, siguen llegando de otras partes, especialmente de escuelas donde trabajan profesores Misioneros seglares y de los que son dirigidos por religiosas, tampoco de otros lugares
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